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Biology Visual Lab assets

心臓の3Dモデル

Local file Source Creator License
heart-bp3d.bin / heart-bp3d.json BodyParts3D / Anatomography The Database Center for Life Science (DBCLS) CC BY-SA 2.1 JP

必須のクレジット表記

BodyParts3D, (c) The Database Center for Life Science licensed under CC Attribution-Share Alike 2.1 Japan

この表記は、心臓ラボの画面内(3Dビューの下)にも常時表示しています。

改変の内容

元データ(partof_BP3D_4.0_obj_99、OBJ形式・1258ファイル・約218MB)に対し、 教材で使えるようにするため次の加工を行いました。

  1. 部位の抽出 — 心臓の学習に必要な8部位のみを選択(右心房・左心房・右心室・左心室・大動脈・肺動脈・上大静脈・下大静脈)
  2. メッシュの統合 — 1部位が複数のOBJに分かれているため、FMA概念単位でまとめた
  3. ポリゴン削減 — 頂点を格子に量子化してまとめる方式(vertex clustering)で面数を約1/3に削減
  4. 大血管の切り取り — 大動脈・下大静脈は全身にわたるため、心臓周辺(元データ Z≧1150)のみ残した
  5. 座標の正規化 — 全体を原点中心・高さ2.0に収め、Y軸を上に変換
  6. バイナリ化 — Float32の頂点座標とUint16のインデックスを1ファイルにまとめた

変換スクリプトは同ディレクトリの build_heart.py です。

ShareAlike(継承)について

CC BY-SA 2.1 JP のため、この3Dデータおよびその派生物は同じライセンスで提供されます。 heart-bp3d.bin、heart-bp3d.json、および変換スクリプト build_heart.py が対象です。

サイトの他のコンテンツ(教材本文、シミュレーターのコード)は、この継承条件の対象外です。

元データの入手元

  • ダウンロード: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html
  • 使用アーカイブ: partof_BP3D_4.0_obj_99.zip
  • 部位名対応表: partof_parts_list.txt(日本語) / partof_element_parts.txt(FMA→ファイルID)

出典論文

Mitsuhashi N, Fujieda K, Tamura T, Kawamoto S, Takagi T, Okubo K. BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts. Nucleic Acids Research 2009, 37(Database issue):D782-5.

注意

このモデルは学習用です。実際の個人の解剖学的構造には個人差があり、 医学的な診断・判断の根拠として使用できるものではありません。